Вузовская наука рассматривалась в СССР как элемент планового социалистического хозяйства. Наука в университетах имперского периода критиковалась за стихийность, несистемность, излишнюю персонификацию, тогда как новая наука социализма должна была обеспечить рост именно за счет организации планирования.
В вопросах планирования вузовской науки акцент делался на координации планов разных участников научного процесса с целью оптимизировать работу, избежать дублирования и параллелизма.
В 1940-х гг. был предусмотрен следующий алгоритм действий. 
Каждый наркомат, в ведении которого находились вузы и НИИ, должен был ежегодно устанавливать список важнейших научно-технических проблем, которые могли быть приняты к разработке исполнителями, в том числе вузовскими кафедрами, лабораториями, НИИ, или отдельными исследователями и коллективами.
В свою очередь, вузы формировали ежегодные тематические планы НИР путем сбора предложений от кафедр; эти предложения обсуждались и утверждались на ученом совете вуза. Сформированные планы высылались вузами на согласование в Главное управление учебных заведений наркоматов по подчиненности. 
На следующем этапе Главк должен был оценить научную тематику подведомственных вузов на предмет соответствия задачам отрасли и текущим потребностям, согласовывать планы вузов, НИИ и лабораторий между собой и выслать уточненный план каждого вуза в ВКВШ. У Всесоюзного комитета задача была еще более сложной: он был призван скоординировать планы всех наркоматов с планами АН СССР и вернуть обновленные планы вузам, где на их основании составлялись индивидуальные планы научной работы сотрудников кафедр.