Во все три периода (имперский, советский, постсоветский) в отечественных университетах наличествовали корпоративные структуры, что позволяет констатировать некоторые элементы университетской автономии. В дореволюционной России советы университетов занимались учебными и кадровыми вопросами, а в некоторые периоды (1804–1835, 1863–1884,1905–1917 гг.) даже могли выбрать ректоров. После революции 1917 года советы университетов сохранились, в 1920-е гг. они были органами университетской автономии и самоуправления, но после сталинской вузовской реформы 1930-х гг. и вплоть до перестройки попали под контроль ректоров (в сталинскую эпоху – директоров). С 1991 по 2000 гг. ученые советы университетов расширили свои права и снова получили возможность избирать ректоров, после 2000-х гг. эта возможность формально сохранилась, но фактически через назначение и.о., назначение членов совета, утверждение кандидатов ректора назначаются министерством (или непосредственно президентом и председателем правительства в случае отдельных, «элитных» университетов).