В статье рассмотрена история развития микробиологической дисциплины в Императорском Казанском университете в XIX - начале ХХ века. Показано, что данная дисциплина развивалась параллельно на естественно-научном отделении физико- математического факультета и медицинском факультете. Показано, что наибольшего развития достигла медицинская микробиология. В статье рассмотрены основные этапы ее формирования.