Впервые на примере Томского университета проведена историческая реконструкция российского университета как научного центра. На широком источниковом материале рассмотрена история становления и деятельности общества естествоиспытателей и врачей, юридического общества и акушерско-гинекологического общества при Императорском Томском университете. Представлен исторический обзор участия томских ученых в работе других научных обществ.