Согласно уставу 1884 г., структура университетов включала 4 факультета: медицинский, физико-математический, юридический, историко-филологический. Хотя университеты позднеимперской России имели в этом отношении определенные отличия (Томский университет до 1898 г., а Саратовский до 1917 г. действовали в составе одного медицинского факультета; тот же Томский с 1898 по 1917 гг. – в составе медицинского и юридического; в составе С.-Петербургского (Петроградского) университета отсутствовал медицинский факультет, но был уникальный – факультет восточных языков; в составе Юрьевского (до 1892 г. – Дерптского) университета, кроме 4-х названных, функционировал также единственный во всей университетской системе той эпохи богословский факультет). Эти направления определяли и характер научных исследований, организованных в университетах, а сами установки во взаимоотношениях внутри профессорско-преподавательской коллегии, несмотря на определенные диспропорции в количестве ученых и научных трудов по разным наукам, не позволяли чаще всего выделять особую значимость того или иного разряда наук, хотя дисциплинарный шовинизм как явление существовал во все времена.